Úspěšní absolventi oboru Tropická agroekologie se mohou uplatnit jako manažeři, experti, konzultanti a odborní poradci v soukromých společnostech, vládních i nevládních institucích, organizacích a úřadech; projektoví manažeři zaměřující se na přípravu, řízení, realizaci, monitorování a hodnocení projektů zaměřených především na udržitelné potravinové a zemědělské systémy; mladí vědci a výzkumní pracovníci v oblasti zemědělství a ekologie, kteří mohou pokračovat v doktorském studiu nebo pracovat na univerzitách a výzkumných ústavech.